1、微生物菌株鑒定服務詳細內容
微生物因為體積小、質量輕、適應性強、繁殖能力強等特點,廣泛分布于自然界中。通過DNA測序對微生物進行物種鑒定(菌種鑒定)是比傳統生化鑒定更先進的鑒定方法。DNA測序不依賴菌種本身特點,對所有菌種均可使用。比傳統生化鑒定更加快速,準確。明舟生物憑借多年的微生物檢測經驗為您可提供快速、權威的微生物檢測服務,包括細菌16srDNA鑒定和真菌18srDNA鑒定/真菌ITS鑒定。
2、細菌16srDNA鑒定
16S rDNA是編碼原核生物核糖體小亞基rRNA (16S rRNA)的DNA序列,長度約為1540bp,存在于所有細菌染色體基因組中。16S rDNA分子大小適中,突變率小,是細菌系統分類學研究中常用、有用的“分子鐘”。其序列包含9或10個可變區(variable region)和11個恒定區(constant region)。保守序列區域反映了生物物種間的親緣關系,而高變序列區域則能體現物種間的差異。16S rDNA分子的序列特征為不同分類級別的近緣種系統分類奠定了分子生物學基礎。近幾年來,國內外學者采用不同的分子生物學方法對各種細菌的16S rDNA進行了廣泛的研究,獲得了大量的16S rDNA序列信息,并集中于NCBI數據庫中。將測序得到的16S rDNA序列在NCBI上進行Blast比對,即可獲知與該序列同源性較高的已知序列,為確定菌種的分類學地位提供依據。
3、送樣要求
1)、若提供平板、甘油菌或穿刺菌,請注明培養條件,菌種培養需特殊培養基的請提供培養基;請確保您提供的平板或斜面上的單菌落經過至少三次的分離純化。因實驗樣品不純造成的測序套峰,我們將收取全額的實驗費用。
2)、若提供基因組DNA樣品,請確保其濃度≥10ng/μl,總體積≥50μl,樣品定量檢測結果將以我們為準。
3)、若提供的菌株為革蘭氏陽性菌,建議您提供基因組DNA。
4)、若提供的為培養后的菌液,請確保包裝的密封性和菌液的濃度,使終離心后菌體質量不低于0.5g。
5)、我們不接受具有致病性的樣品。如果您的菌株帶有致病性,請提供該菌株的基因組DNA,并對其進行處理以滅活致病菌。
4、提供結果
1)、進行引物設計合成;
2)、 PCR擴增18S rDNA/ITS;
3)、PCR產物純化;
4)、測序,序列比對分析。
5、 序列文件
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